(3) それゆけBioinformatics

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2006年11月05日

CytoscapeとMS Excelファイル

Cytoscape Info.さんの 10/31の記事によりますと、次期リリースのCytoscape2.4では MS Excelファイルのインポートが可能になるようです。

となると、 Pajekよりはるかに使い勝手が向上しますね。

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【関連する記事】

posted by soreyuke at 04:16| Comment(1) | TrackBack(0) | tools |

2006年10月27日

書籍：Rの基礎とプログラミング技法

ちょっと気になる、Rに関する書籍紹介。

U.リゲス著, 石田基広訳
Rの基礎とプログラミング技法
シュプリンガー・フェアラーク東京 (ISBN：4-431-71218-6)
3,675円（税込）

著者ページ（Rソースなどが公開されています）
http://www.statistik.uni-dortmund.de/~ligges/PmitR/

posted by soreyuke at 20:05| Comment(0) | TrackBack(0) | books |

Mozilla Firefox 2登場！

すでにダウンロード・インストールされた方も多いと思いますが、Mozilla Firefox 2が二日前に公開されました。これまでより速く・安全に動作し、カスタマイズも便利になった新バージョンです。

拡張機能やテーマなどのアドオンに関する日本語ページも用意されているようですので、是非これを機に他ブラウザから乗り換えを考えてみてはいかがでしょうか。

posted by soreyuke at 14:50| Comment(0) | TrackBack(0) | Mozilla Firefox |

2006年09月14日

Mozilla Firefox Plugins (Aracyc and Tair) for plant research

探した限り見当たらなかったので、AraCycとTair (のgeneに対してのみ) を検索できるように、Firefoxの検索プラグインを用意しました。既にあったとしたら、ゴメンナサイなのですが、、、。

AraCyc.src
AraCyc.png

TAIR-GENE.src
TAIR-GENE.png

インストール方法：Windowsであれば、C:\Program Files\Mozilla Firefox\searchplugins\などが置き場所になります。プラグインのソースファイルと画像ファイル (.srcと.png)を格納するだけです。

削除の方法：Firefox を終了し、上記のフォルダから削除したい検索プラグインのソールファイルと画像ファイル (.src と.png) を手動で削除してください。

↓動作状況はこんな感じです。

///////////////////////////////////////////////////////////////
Here are some Mozilla Firefox searchplugins for plant research.
To install these, just drop the "plugin-name.src" and "plugin-name.png"
files into the /MozillaFirefox/searchplugins/ directory.

AraCyc: Search AraCyc which is a metabolic pathway database for Arabidopsis.

AraCyc.src
AraCyc.png

TAIR-GENE: Search The Arabidopsis Information Resource (TAIR http://www.arabidopsis.org/) Gene.

TAIR-GENE.src
TAIR-GENE.png

To uninstall, please delete the "plugin-name.src" and "plugin-name.gif"
files from the "searchplugins" directory.

Good luck!

posted by soreyuke at 18:56| Comment(2) | TrackBack(0) | Mozilla Firefox |

2006年09月02日

Firefoxマスコットに名付けちゃいましょ

Mozilla JapanからMade in JapanなFirefoxのマスコットが出来たそうです。9/14日午後12時まで名前を下記サイトで募集中ですって！！

Firefox に日本発のマスコット登場！だれか僕の名付け親になってください!!
http://spreadfirefox.jp/mascot/

この子を通して、たくさんの人にFirefoxの存在を知って欲しいと願っております。

関連記事
Firefox に日本発のマスコット登場!? 名前を大募集!!
http://www.spreadfirefox.com/node/24946

posted by soreyuke at 11:34| Comment(0) | TrackBack(1) | Mozilla Firefox |

2006年08月28日

何がわからないのか

生体のゆらぎとリズム-コンピュータ解析入門-
和田孝雄著　講談社サイエンティフィク

http://www.amazon.co.jp/gp/product/4061536540/

という書籍の第0章は一読の価値があります。

特に数式に拒否反応が出る方など。。。

大学だけでなく、教育者の多くが基礎教育の大事さを説く。それはそれで結構であるが、おかげさまで基礎教育だけで止まってしまって先に進めないのである。実はやる気のある人間であれば、どうせ基礎の本は自分で読むにきまっているのだから、はじめから高度なことに入らせたほうがよいのである。
　　　　　　　　　　　　　　　　　　（生体のゆらぎとリズム第0章より）

なんか目からウロコでした。

posted by soreyuke at 20:16| Comment(0) | TrackBack(0) | books |

2006年08月11日

今日の気になる書籍

複雑系叢書（全7巻）
早稲田大学複雑系高等学術研究所　編
編集委員：相澤洋二・稲葉敏夫・鈴木　平・橋本周司・前田惠一・松本　隆・三輪敬之
http://www.kyoritsu-pub.co.jp/series/fukuzatukei.html

※いや、まだ読んで無いんですけど、、、気になるということで。

ブラウン運動（物理学One Point 27）
米沢富美子　著
http://www.kyoritsu-pub.co.jp/juhan/j03236-5.html

※重版です。物理の人だけでなく、化学・生物の人にも是非読んで欲しい一冊。飲み会の席で、アボガドロ数に関して語りたくなっちゃうかも。

posted by soreyuke at 11:57| Comment(0) | TrackBack(0) | books |